近年来，昭通学院重点打造高原特色农业、昭通文学、教师教育、红色文化四张特色牌。学校围绕高原特色牌，结合昭通天麻产业特点，以学科专业建设为主线，以人才培养和科学研究为两翼，本着“对接产业、突出重点、打造特色、形成品牌”的学科专业建设思路，大力推进特色学科专业建设。先后成立了天麻研究院、天麻学院，从省内外选聘天麻产业人才，开设了天麻特色人才班，积极开展天麻特色研究、社会服务和产业人才培养。2022年6月，申报的“冷凉高地特色作物与生物资源学”入选云南省一流建设学科新学科培育计划立项。2023年7月，植物科学与技术专业、食品质量与安全两个专业获批云南省B级专业建设点立项。2023年8月，云南省教育厅、昭通市签订《省教育厅、昭通市共建昭通学院协议》，为昭通学院特色发展、内涵式发展、高质量发展奠定坚实的基础。
据了解，昭通学院积极与上海药物研究所、中国农业大学、西北农林科技大学、昆明植物研究所、昆明理工大学、云南农业大学、昭通天麻研究院等高校和院所开展科技交流20余场次，达成合作意向5项；与中国科学院上海药物研究所联合申报“云南天麻特色品质与中枢功效解析及深度产品研发”项目已通过初审，进入实质评审阶段；2023年4月1月至3日，成功举办云南天麻产业发展高端论坛，国内10余所高校及科研机构的30余名专家学者齐聚昭通，分享天麻研究成果，共谋产业发展良策。通过校企合作，昭通学院申请并获批天麻绿色种植与加工工程研究中心、省天麻与真菌共生生物学重点实验室、云南省院士专家工作站；建设了“昭通高原特色农产品检测平台”“云南省高校创新团队”“云南省高校重点实验室”等省部级科研平台，为天麻现代产业学院的建设奠定了坚实的基础。
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